2008年5月17日－21日，卫生部部长陈竺率中国代表团出席在瑞士日内瓦举行的世界卫生组织（WHO）第61届世界卫生大会。

5月18日，陈竺部长与世卫组织总干事陈冯富珍共同签署了中国政府向世卫组织自愿捐款协议。根据该协议，中国政府将向世卫组织自愿捐款192万美元，用于支持世卫组织总部和西太平洋地区办事处开展传染病防治、营养和食品安全、慢性病防治、卫生系统和服务、环境卫生、医疗产品和技术等领域的活动。最近两年，中国政府已向世卫组织自愿捐款共约900多万美元，支持世卫组织相关领域的工作。

陈竺向陈冯富珍简要介绍了四川地震灾情和抗震救灾情况、安徽手足口病疫情和防控进展，并就青蒿素产品等药品预审机制、传统医学、中国与世卫组织的国家合作战略等议题交换了意见。他感谢世卫组织对中国卫生事业发展的支持，并希望加强灾难医学领域的合作。陈冯富珍表示，世卫组织对四川地震遇难者表示哀悼，并愿意全力提供相关的技术支持。她相信，中国政府有能力应对此次灾情，抗震救灾，重建家园。

陈竺部长会见了本届大会主席、圭亚那卫生部长Leslie Ramsammy博士。双方讨论了慢性病防控战略、艾滋病防治等全球公共卫生议题，并一致赞同在我向圭亚那派遣医疗队的良好合作基础上，进一步加强中圭双边卫生合作与交流。

5月19日，大会正式开始。应第60届世界卫生大会主席、澳大利亚卫生部秘书长Jane Halton女士的提议，全体与会代表起立，为缅甸热带风暴和中国地震灾害中的遇难者表示深切哀悼。陈竺部长随后发言。他表示，中国四川发生特大地震后，中国政府和各族人民迅速行动起来，展开抗震救灾工作。目前，各项救灾工作正在紧张、有序、高效进行。他感谢国际社会所给予的支持和帮助，并强调，中国政府有能力应对此次特大自然灾害，中国人民不会被灾难吓倒。

此外，陈竺部长还参加了大会会务委员会会议和全体会议，并在一般辩论性发言中，围绕卫生相关的千年发展目标发表了讲话。

5月20日，陈竺部长与世卫组织西太区主任尾身茂共同启动了中国政府与WHO的国家合作战略框架（2008年－2013年）。该战略框架明确了加强卫生体系，实现基本卫生服务的普遍可及，加强慢性病防控、应对新发公共卫生威胁，实现卫生相关的千年发展目标等重点合作领域。陈竺表示，希望通过国家战略的实施，进一步加强中国政府与世卫组织的密切合作，特别是在重点领域的合作，利用世卫组织的技术优势，推动中国卫生事业的不断发展。

会议期间，陈竺部长还会见了英国、加拿大、挪威、韩国、巴基斯坦、南非、阿尔及利亚、苏丹、尼泊尔、白俄罗斯、津巴布韦等国卫生部长，以及联合国艾滋病规划署（UNAIDS）副执行主任，讨论了进一步加强人才培训、生物医学研究、结核病与艾滋病防控、灾难医学等方面的合作与交流。

会见中，各方均对中国四川地震表示同情和哀悼，并肯定中国政府所采取的积极措施，表示愿意提供力所能及的支持和帮助。南非卫生部长M.E. Tshabalala Msimang博士代表非洲联盟卫生部长，面呈了关于我国地震灾害的声明。声明全文如下：

“我们，非洲联盟卫生部长们，于2008年5月17日在瑞士日内瓦召开特别会议：

一、向中华人民共和国政府和人民在近期地震灾害中遭受的严重损失表示深切哀悼。

二、鼓励国际社会帮助中国在抗震救灾以及随后的灾后重建中，应对物质、社会和精神卫生方面的挑战。

三、我们将与中国人民共和国政府和人民团结在一起，共同面对当前的困难。”